نظام الحكم فيدرالي، وتتكون الحكومة من:
- السلطة التنفيذية
- السلطة التشريعية
- السلطة القضائية
إن التاريخ السياسي الصومالي ما بعد الاستقلال وإلى يومنا هذا يمكن تقسيمه إلى خمسة مراحل هي عبارة عن حلقات متتالية متوالدة مهدت كل واحدة منها الأخرى وهذه المراحل هي:
المرحلة الأولى: الحكومات المدنية، في عهد فخامة الرئيس (أدم عبدلي عثمان 1960-1967م) وعهد (عبدالرشيد علي شرماركي من فترة 1967 الى أن اغتيل في عام 1969م ).
المرحلة الثانية: الحكومة العسكرية (1969-1991م) في عهد فخامة الرئيس محمد سياد بري.
المرحلة الثالثة: الجبهات المسلحة (1991-2000م)، فترة الحروب الأهلية والصراعات القبلية.
المرحلة الرابعة: الحكومات الانتقالية، في عهد فخامة الرئيس عبد القاسم صلاد حسن (2000 – 2004م) وعهد الرئيس الراحل عبدالله يوسف أحمد (2004 – 2008م)، وعهد الرئيس شيخ شريف شيخ أحمد (2008-2012م).
المرحلة الخامسة: الحكومة الفيدرالية
2012م حتى فبراير 2017م، في عهد فخامة الرئيس السابق حسن شيخ محمود.
8/2/2017م، تم انتخاب فخامة الرئيس/ محمد عبدالله محمد فرماجو - رئيساً لجمهورية الصومال الفيدرالية.
أهم الولايات الفيدرالية
- ولاية بونت لاند، وعاصمتها جروي
- ولاية جنوب وغرب الصومال، وعاصمتها المؤقت بيدوا
- ولاية جلمدغ، وعاصمتها المؤقت عذاذو
- ولاية جوبالاند، وعاصمتها كسمايو
- ولاية هيرشبيلي، وعاصمتها جوهر
- إقليم صومالي لاند وعاصمتها هرجيسا (أعلن إنفصاله عن جمهورية الصومال الفيدرالية)